Au début du XXe siècle, la forte poussée démographique et l'essor toujours grandissant du protestantisme à Lesconil, amènent le diocèse à envisager la création d'une église catholique près du port. Cette chapelle, construite en 1902, ne deviendra l'église paroissiale Notre-Dame-de-la-Mer (ou Notre-Dame des Flots) qu'en 1924.
La tombe du premier recteur se trouve à son chevet, l'abbé Le Mel. L'église a été restaurée en 2015.
La tombe du premier recteur se trouve à son chevet, l'abbé Le Mel. L'église a été restaurée en 2015.